MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-3 DNA

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020826	T	6	6	9	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020826	T	6	6	36	41	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020826	TGA	2	6	77	82	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020826	TTA	3	9	216	224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020826	GAAA	2	8	1346	1353	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020826	G	6	6	1390	1395	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020826	A	6	6	2048	2053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020826	TAA	3	9	2094	2102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020826	TTAA	2	8	2118	2125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020826	GAT	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020826	CTA	2	6	2196	2201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_020826	AAAT	2	8	2205	2212	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020826	TCATT	2	10	5030	5039	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_020826	ATTA	2	8	5919	5926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020826	GGT	2	6	6099	6104	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020826	ATT	2	6	6291	6296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020826	A	7	7	6491	6497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020826	GTTT	2	8	7092	7099	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_020826	GTA	2	6	10424	10429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020826	T	6	6	10492	10497	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020826	CAT	2	6	10503	10508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020826	CAG	2	6	10521	10526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020826	T	6	6	10535	10540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020826	TAA	2	6	10898	10903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020826	T	6	6	10916	10921	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020826	A	8	8	10940	10947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020826	AAAC	2	8	10993	11000	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_020826	A	6	6	11011	11016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020826	AAAG	2	8	11104	11111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020826	ATC	2	6	11169	11174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020826	GAG	2	6	11259	11264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020826	CATT	2	8	11281	11288	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020826	ATG	2	6	11344	11349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020826	CAA	2	6	11380	11385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_020826	GTT	2	6	11459	11464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020826	CTT	2	6	11505	11510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020826	ATT	2	6	11512	11517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020826	ATT	2	6	11708	11713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020826	TTG	2	6	11728	11733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020826	GACC	2	8	11780	11787	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_020826	CT	3	6	11788	11793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_020826	TAAT	2	8	11953	11960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020826	ACAA	2	8	20112	20119	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_020826	TAAC	2	8	20132	20139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_020826	CCCA	2	8	20169	20176	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_020826	TGG	2	6	20178	20183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020826	ACC	2	6	20197	20202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_020826	GCTT	2	8	20239	20246	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_020826	AAT	2	6	20292	20297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020826	GATTT	2	10	20350	20359	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020826	GTT	2	6	20367	20372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020826	ATT	2	6	20424	20429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020826	CTT	2	6	20458	20463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020826	ATC	2	6	20473	20478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020826	TTA	2	6	20544	20549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020826	A	8	8	20565	20572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020826	CAA	2	6	20645	20650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_020826	TCTAT	2	10	20689	20698	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_020826	A	6	6	20746	20751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020826	CA	3	6	21594	21599	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020826	TA	5	10	21790	21799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020826	AAG	2	6	21825	21830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020826	T	6	6	22122	22127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020826	CTTTG	2	10	23517	23526	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020826	GTT	2	6	23539	23544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020826	GTTC	2	8	25763	25770	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_020826	TGT	2	6	27948	27953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020826	ACA	2	6	27993	27998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_020826	ATTC	2	8	28003	28010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_020826	TCT	2	6	28046	28051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_020826	T	6	6	28711	28716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020826	TCAA	2	8	28751	28758	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_020826	TTC	2	6	29485	29490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_020826	AATTT	2	10	29509	29518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020826	ACAGA	2	10	29601	29610	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_020826	CTA	2	6	29614	29619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020826	AG	3	6	30935	30940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020826	CATT	2	8	31003	31010	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_020826	T	6	6	31072	31077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020826	AAC	2	6	31085	31090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_020826	A	6	6	31091	31096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020826	TCT	2	6	31337	31342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020826	GTT	2	6	31348	31353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020826	ATT	2	6	31395	31400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020826	CAA	2	6	31437	31442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_020826	ATT	2	6	31465	31470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020826	AATTA	2	10	31484	31493	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020826	A	6	6	31497	31502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020826	TGT	2	6	31524	31529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020826	CCT	2	6	32603	32608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_020826	T	7	7	32673	32679	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020826	TGT	2	6	32683	32688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020826	TAG	2	6	32714	32719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020826	GTA	2	6	32779	32784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020826	GTG	2	6	32816	32821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020826	TG	3	6	32846	32851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020826	CTA	2	6	33456	33461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020826	TTG	2	6	33611	33616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020826	CCT	2	6	35237	35242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_020826	ATT	2	6	35277	35282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020826	A	6	6	35300	35305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.